Web蛋白质motif分析. 模体Motif(基序),指DNA或蛋白质序列中局部的保守区域,或者是一组序列中共有的一小段序列模式,在生物学中是一个基于数据的数学统计模型。. 可以根据蛋白质序列特征(比如基于蛋白质基序)进行功能预测。. 具有相同基序或结构域的蛋白 ... WebMembrane-less organelle dysregulation and cardiomyopathy. RNA-binding motif protein 20 (RBM20) is a striated muscle-specific nuclear alternative splicing factor that acts as an important regulator of mRNA splicing of a subset of genes involved in cardiac development and plays an important role in the regulation of the titin (TTN) splicing (Guo ...
HOMER MEME 转录因子的靶基因预测 motif富集分析 ...
http://homer.ucsd.edu/homer/motif/motifDatabase.html WebTAMO ( Tools for Analysis of MOtifs) is an object-oriented computational framework for interpreting transcriptional regulation using DNA-sequence motifs. To simplify the application of multiple motif greenlee dm 20 instruction manual
EF-hand calcium-binding proteins - PubMed
WebMar 25, 2024 · 用于寻找motif 区域大小使用("-size <#>")设置。HOMER 一般选取基因TSS +/- 50kb区域分成设定大小;然后计算这些背景序列GC/CpG% 储存起来用于后续分析。 4.5 随机选择背景区域用于寻找motif 因为HOMER 使用一个不同的motif 寻找算法,它需要使用背景序列区域作为对照。 Web转录因子motif TSS区域富集分析 motif enrichment HOMER FIMO MEME. 目的:假设你有一个感兴趣的TF,且这个TF的DNA binding motif已知,那么就可以预测这个TF的motif在其target gene的promoter(TSS附近)的富集信息。. 【需结合表观数据使用】. WebMar 20, 2024 · HOMER Motif Analysis - 根据ChIP-seq和ATAC-seq的peak结果寻找可能binding的motif Finding Enriched Motifs in Genomic Regions (findMotifsGenome.pl) - 核心的脚本 Finding Instance of Specific … greenlee dvc 6 electrical tester